先秦时，邱姓主要活动于山东，秦汉时进入江淮，浙江绍兴邱氏发展迅速，在南北朝时形成著名的吴兴邱氏，而唐宋时邱姓人口有南下入闽，至宋朝邱姓已经成为江浙、闽中大姓。 晓澳邱氏开基始祖为邱恒，于元顺帝至正五年（1345年）自筱埕迁居筱江（晓澳），至五世孙发三房，八世孙分立八房，人口繁盛，为连江县大姓。 O-F3386 下游福州一带的邱姓可能属这一家族，而 O-F3386 下游的邱姓亦见于湖北武汉、孝感一带，两支邱氏家族之间的具体关系暂不清楚，据谱载，晓澳邱氏于元末已居福建，但该支邱氏更早源于何处并无详细记载，该家族的形成发展历史，以及各支派分化情况、后裔分布状况等还需要更多的用户参与“父系深度检测”进一步确认。